宇宙纪元（，通称C.E.），为GUNDAM系列作品之一的《机动战士GUNDAM SEED》系列所采用的纪元。包含《机动战士GUNDAM SEED》（下称《SEED》）、《机动战士GUNDAM SEED DESTINY》（下称《SEED DESTINY》）、《机动战士钢弹 SEED C.E.73 STARGAZER》（下称《STARGAZER》）及相关外传等，C.E.作为整个系列故事的背景、世界观与时间轴。C.E.与GUNDAM系列作品中的元祖Universal Century（通称U.C.、宇宙世纪）有部分相似之处，不过C.E.纪元较偏重对基因改造、族群冲突的描述，而有别于宇宙世纪较富神秘主义风格的新-{人类（New Type）概念。 《SEED》的续篇《SEED DESTINY》的问世，使得C.E.成为继U.C.之后首支拥有二部以上TV版动画的纪元，另外C.E.亦是GUNDAM系列作品中除U.C.外，唯一拥有MSV（Mobile Suit Variations）的第二大系列。 目前U.C.仍是所有钢弹纪元中最为庞大的，单以「动画」这一媒体而言，四十多年的时间让它发展出四部独立TV版，七部OVA和其编辑成的电影和OVA，十多部剧场版（其中六部是作为两套三部曲形式）。在C.E.之前，《新机动战记GUNDAMW》的A.C.纪元是继U.C.之后发展最完善的，其拥有TV版、OVA和剧场版各一部。 C.E.系列平台. "X"plosion GUNDAM SEED. "X"plosion的X表示「未知的事物」，同时发音有著英语Explosion(爆发)的双关，Xplosion是两者意义的结合，有著「无限的可能性」的意味在 。 2006年5月7日，官方于「Sony Music Anime Festival'06」上发表「"X"plosion GUNDAM SEED」公式网站，以及「剧场版 机动战士钢弹 SEED（暂称）」制作决定的情报引发轰动。官方表示正启动全新的企划，2006年春季以后将有新的映像、活动等陆续展开；今后关于SEED世界的总合情报，都将于「"X"plosion GUNDAM SEED」上率先揭露。官方更宣称SEED迈向新的阶段，将大范围进行映像、OVA、漫画、活动等企划。一般认为，官方准备将C.E.的生命延续下去，在各种媒体上推出相关作品，将其打造为与U.C.相提并论的宏大世界。 同年6月各大动画专门杂志均确认「剧场版 机动战士钢弹 SEED（暂称）」制作决定的新闻，「"X"plosion GUNDAM SEED」网页上宣称这将是「机动战士GUNDAM F91」以来钢弹系列的首部完全新作电影。然而结果却是只闻楼梯响，自OVA「机动战士钢弹 SEED C.E.73 STARGAZER」依照预定推出之后，数年来公式网站仅零星更新漫画版ASTRAY系列和TV动画版DVD-BOX发售的情报，包括剧场版在内的其他企划有如消失一般不再被提及。 2007年10月，TV动画版「机动战士钢弹 00」播映，SEED则呈现停滞状态。 2008年4月，脚本家两泽千晶于杂志访谈上表示由于卵巢和子宫颈肿瘤的手术，自身仍在疗养中导致剧场版企划的延宕，待病况恢复后将会回到工作上。 2008年6月，「"X"plosion GUNDAM SEED」发表1/100 MG威力型脉冲钢弹模型将同捆特别宣传用影片，强调CG映像制作的「PHASE-IMPULSE」。 2008年8月，「"X"plosion GUNDAM SEED」发表监督福田己津央与SEED剧组重要成员一起介绍「PHASE-IMPULSE」的对谈，此影片后来颇受好评。 2009年1月，监督福田己津央于SUNRISE的新年广播节目上表示欲制作剧场版，并透露「今年会发表一些正式消息吧...希望可以。」 2009年3月，「机动战士钢弹 00」的剧场版公开，SEED的剧场版无进一步情报。 2010年9月，「剧场版 机动战士钢弹 00 -A wakening of the Trailblazer-」于日本公映。 2010年11月，「"X"plosion GUNDAM SEED」发表SEED/SEED Destiny Special Edition DVD-BOX的发售预定情报。 2011年4月，机械设定大河原邦男于Twiiter上对于留言询问SEED剧场版的回复是「为电影而做的（机械）设计已完成80%」、「制作预定并未取消」、「六月份会有GUNDAM新作发表」。 2011年6月13日，钢弹新作「机动战士钢弹 AGE」制作发表，同年同月25日漫画版「机动战士钢弹 THE ORIGIN」动画化发表，没有SEED相关消息。 2011年8月26日，「"X"plosion GUNDAM SEED」发表「SEED HD Remaster Project」，SEED系列两部TV动画作品将于十周年的2012年启动高画质再录制企划，画面尺寸升级为16:9，加入新规作画与新编乐曲，并以Blu-ray BOX的形式发售。 过去二、三年间，亦有不少观众于福田己津央的Twiiter上多次留言询问关于新作的事，福田皆以SUNRISE内部要求谨守保密义务为由表示无可奉告，只能请大家期待。 2012年元月1日，SEED HD Remaster于日本BS11电视台开始播映，这是首度钢弹旧作高画质化后还能再次作为TV节目的。 2012年6月16日，官方举办「SEED PARTY 2012～星空集会～PHASE-1.0」，这是一场集合监督福田己津央和主要角色声优的Talk Show，交流分享SEED制作之心得及秘辛。 2012年9月30日，官方举办「SEED PARTY 2012～星空集会～PHASE-2.0」。 2012年11月25日，SEED HD Remaster播毕，官方同时发表「SEED DESTINY HD Remaster」。 2012年12月1日，官方举办「SEED PARTY 2012～星空集会～PHASE-3.0」。 2013年4月7日，SEED DESTINY HD Remaster于日本BS11电视台开始播映。 官方预定于2014年2月21日举办「SEED PARTY 2014～命运集会～FINAL PHASE」作为两年来SEED HD Remaster Project完结的庆祝活动。 C.E.系列的MS. 《机动战士GUNDAM SEED》（C.E. 70年 - C.E. 71年）. OMNI ZAFT ORB、三舰同盟 ※原ZAFT MS 《机动战士GUNDAM SEED C.E.73 STARGAZER》（C.E. 73年）. DSSD ZAFT 幻痛 《机动战士GUNDAM SEED DESTINY》（C.E. 69年 - C.E.74年）. ZAFT 幻痛 ORB、三舰同盟 重建战争爆发。 乔治·葛伦出生（4月1日）。 重建战争的中亚战线（喀什米尔地区）使用了核弹（“最后之核”）。以此为契机，其后的世界纷争结束的机会日渐升高。 乔治·葛伦获得诺贝尔奖的提名。 乔治·葛伦加入海军。 重建战争结束。由美国、英国、加拿大、冰岛所组成的大西洋联邦，由欧洲各国所组成的欧亚联邦，由中国、台湾、日本与韩国（南韩和北韩已统一）所组成的东亚共和国等区域性组织相继成立。联合国颁布Cosmic Era宇宙纪元历法，并公布新的宇宙开发计划。因为重建战争而冻结的L1宙域第四代国际太空站—世界树，再度开始建造。 殖民卫星构想付诸实行。用于调运材料与组合基地为目的的哥白尼月面基地开始建造。曾因新瓶颈而停滞的宇宙商业再度盛行。乔治·葛伦加入大西洋联邦的联邦航空宇宙局（Federal Aeronautics and Administration）。大西洋联邦设立联邦宇宙军（Federal Space Force）。欧亚联邦、东亚共和国随后也设立自己本国的宇宙军。 位在L1宙域的第四代国际太空站—世界树完成。 第一个可供平民居住的月面都市—哥白尼完成。联邦航空宇宙局启动木星探测计划，乔治·葛伦以计划主任的身分，成为计划的领导人。公开木星往返船“齐奥尔科夫斯基”的建造计划并在L1宙域的世界树国际太空站开始建造木星往返船。 木星往返船“齐奥尔科夫斯基”完工。齐奥尔科夫斯基内，搭载了后来的泛用型兵器机动战士的始祖，具有覆于外部的骨架以及辅助动力装备的宇宙作业服。在木星探测船“齐奥尔科夫斯基”出发时，乔治·葛伦发表了《乔治·葛伦的告白》，公开调整者的存在，并在网路上公开制造调整者详细的科学资料。全世界就此究竟是对是错而陷入混乱。各宗教界的威权认为此技术侵犯了“神的领域”而感到恐惧，将此技术认定为异端，甚至将阅读有关资料视为背离教义。以自然环境保护为诉求的压力团体「蓝色宇宙」，对调整者的技术表示反对。 举行了讨论调整者相关问题的“联合国基因资源开发会议”。该会议通过了《关于改变人类基因的议定书》，全面禁止修改人类基因等事情。并针对乔治·葛伦一事，则待他在七年后归来之时决定。然而，一部分的富裕阶级却极秘密地将其儿女制成调整者。 秘密制造调整者的芝加哥医院遭遇火灾，发生了医生、护士以及住院病患惨遭虐杀的事件。谣传或许与「蓝色宇宙」有关，但真相不明。根据大西洋联邦与南美共和国所议定的共同开发计划，开始在中美的巴拿马建设「巴拿马之门」。 欧亚联邦、南非统一机构在维多利亚湖畔，开始建设质量投射装置「巧手」。 “齐奥尔科夫斯基”到达木星圈。在卫星—欧罗巴附近的陨石中发现“证据01”并将该消息传回地球。世界再度陷入混乱。联邦航空宇宙局指示将化石携回。西盖尔·克莱因在斯堪的那维亚王国内极秘密地以调整者的身份诞生。 派屈克·萨拉在大西洋联邦极秘密地以调整者的身份诞生。 乔治·葛伦带著“证据01”自木星归来。化石运到了L5宙域的研究用殖民卫星—黄道，进行详细的调查。调查委员会提出报告表示“完全无法找到其为假造品之可能性”，并作出“其智慧在鲸鱼等级，或者是在此之上的可能性相当高”的结论。 各宗教界的领导者参加“巴勒斯坦公会”讨论“证据01”和调整者有关的问题，却无法达到一致的结论。宗教界失去其权威。之后，调整者宽容论在世界蔓延。第一次调整者婴儿潮开始。因宇宙商业的活跃，开始建造大量的殖民卫星。 L4宙域开始大量建造殖民卫星。欧普联合首长国开始建造其质量投射装置—辉夜及其资源卫星—海利欧波里斯。 乔治·葛伦的软禁被解除，并开始在黄道（Zodiac）殖民卫星调查“证据01”-鲸鱼化石。该宇宙殖民地的外星生物研究所，慢慢成为宇宙中的一个大型研究机构。 大西洋联邦在托勒密陨石坑建造军事基地的行动被发现。虽遭到国际非难，但是大西洋联邦辩称该基地是做为“宇宙员警机关”使用，并公开最初的MA系列。各势力开始宇宙军备竞赛。欧亚联邦开始建设宇宙要塞阿尔缇蜜斯。 L5宙域的黄道（Zodiac）殖民卫星的规模扩大，并开始建造其他的殖民卫星。乔治·葛伦发表新型的天秤型宇宙殖民地构想，并且开始建造。由大西洋联邦、东亚共和国、欧亚联邦出资兴建。L5宙域的新型殖民卫星群的所有行动由上述出资国组成的理事会决定。 极秘密地制造的第一代调整者开始崭露头角，无论是在学术、艺术或运动各方面都很活跃。但也因此显露调整者与自然人之间的明显差别，反对势力油然而生。信仰狂热的天主教集团或伊斯兰教基本教义激进派，甚至是「蓝色宇宙」的基础阶层以及所谓的武装性反基因差别主义团体逐渐在地下汇流，产生一个反调整者的联合阵线，世界很快地开始呈现混乱的色彩。 因第一世代的调整者间的婚姻，纯血统的第二世代调整者开始诞生。由于其无疑地继承其双亲的能力，因此新的议论又起。穆达·阿兹莱尔，在大西洋联邦出生。 西盖尔·克莱因与派屈克·萨拉在L5宙域的宇宙殖民地从事建设时相遇。 穆·拉·福拉卡，在大西洋联邦以阿鲁·塔·福拉卡之长子的身份出生。 L5宙域的殖民卫星群的第一群天秤型殖民卫星十座（即日后的阿普里利乌斯市）完成。因作为大规模的生产基地，因而称之为「Prodution Location Ally on Nexas Technology」（P.L.A.N.T.）。 爆发S2型流行感冒，几乎没有调整者受到感染；黄道联盟在西盖尔·克莱因与派屈克·萨拉的领导下成立。 乔治·葛伦被谋杀。凶手是一个年轻的自然人，他因痛恨自己不是调整者而对乔治·葛伦下黑手。P.L.A.N.T.最高评议会成立。 拉克丝·克莱因在P.L.A.N.T.诞生。 悠连·响博士的超级调整者研发计划的唯一完成品—基拉·大和出生。同日其自然人姊妹卡佳里·尤拉·阿斯哈出生。 阿斯兰·萨拉在P.L.A.N.T.诞生。 由大西洋联邦宇宙军（FSF）、欧亚宇宙军、东亚共和国（亚洲共和国）航太宇宙军所组成的联军开始进驻P.L.A.N.T.周边宇域（该部队成为以后地球联合军的前身）。 西盖尔·克莱因与派屈克·萨拉当选为P.L.A.N.T.最高评议会委员；另一方面，“黄道同盟”仍在进行活动，且其支持者也在逐渐增多。 乌兹米·那拉·阿斯哈成为欧普联合首长国的首席代表。轨道电梯天之御柱（Ame-no-Mihashira）的建造开始了。 P.L.A.N.T.逐渐演变为向地球供给能源、工业制品的供给地。使理事国继续获得越来越大的利益，并对P.L.A.N.T.施加越来越重的配额。与此同时，其他国家对P.L.A.N.T.的理事国的垄断利润越来越不满。C.E.61年时派屈克·萨拉在反调整者组织的恐怖袭击中幸存下来，使派屈克·萨拉感觉受到威胁，他将儿子阿斯兰·萨拉送到月面都市—哥白尼留学。在月面都市哥白尼的初中，阿斯兰·萨拉遇到了基拉·大和。C.E.62年时欧普联合首长国卷入与大西洋联邦的领海争端。在C.E.63年P.L.A.N.T.的能源生产部门遭到蓝色宇宙（Blue Cosmos）为首的恐怖分子的破坏。P.L.A.N.T.评议会委员关于暂停向地球传输能量的请求被理事国拒绝。因此，P.L.A.N.T.遭遇了严重的能源危机。为了抗议理事国的决定，P.L.A.N.T.技术人员组织了罢工。作为回应，理事国用他们的机动装甲舰队威胁P.L.A.N.T.。西盖尔·克莱因和派屈克·萨拉成为寻求独立于理事国的最高委员会派系的领导人。而要求P.L.A.N.T.内部独立的呼声越来越高。开发军事化机动战士的秘密项目在暗中开始进行。 第一架机动战士(MS)试作型一号研发完成；黄道联盟改名为自由条约黄道联盟（ZAFT），并加大活动力度，吸引更多支持者。 自由条约黄道联盟以机动战士（MS）试作型一号为基础开发出具有战斗能力的机动战士YMF-01B 原型基恩（PROTO GINN）。Maius市（5月）的一部分被秘密改造并开始生产机动战士原型基恩。 西盖尔·克莱因当选P.L.A.N.T.最高评议会议长。 由自由条约黄道联盟所属的议员占据了最高评议会多数席位，遂决意一切以取得自治权跟贸易自主权为前提，并在一个月后的P.L.A.N.T.运营会议上向理事国表明了这一意向。 理事国对此极为不满，并以武力回应。作为回应，P.L.A.N.T.开始集结军队和武器，并引发对峙。 「蓝色宇宙」继续发展壮大，并声称拥有​​数十万成员（包括自称的成员）。对地球上调整者的迫害越来越严重。至此，几乎所有的调整者都移居到了P.L.A.N.T.。 P.L.A.N.T.评议会力求取得政治上和经济上的独立，西盖尔·克莱因秘密访问南美合众国和大洋洲联盟，之后与南美合众国以及大洋洲连合两国达成并签署了食物输入以及工业输出协议。得知这些协议后，理事国要求西盖尔·克莱因辞职和解散最高评议会，并要求P.L.A.N.T.完全放弃自治。当这些要求被忽视时，他们开始限制向P.L.A.N.T.的食品出口。 同年，从南美合众国输入食物的P.L.A.N.T.籍运输船队（包括货船曼德尔布罗特号）遭到击沉，造成数百名调整者死亡，被称为“曼德尔布罗特号事故”。使P.L.A.N.T.和地球联合的紧张感一口气升到最高，以「曼德尔布洛号事件」为契机，在派屈克·萨拉指导下将「自由条约黄道同盟」解体、再编成，与P.L.A.N.T.内的警察保安组织合并，装备了MS作为主力的Z.A.F.T.（扎夫特）就此创建并建军。议员派屈克·萨拉从月面都市哥白尼那里叫回了阿斯兰·萨拉。阿斯兰要求基拉·大和和他一起去P.L.A.N.T.。基拉留在哥白尼，但承诺他们有一天会再次见面。由于政局恶化，基拉的养父母决定带他搬往欧普联合首长国的资源卫星—海利欧波里斯。 西盖尔·克莱因议长决定在P.L.A.N.T.内开始生产粮食，并将尤尼乌斯市的7～10区改造成谷物生产基地，令理事国方面提出了警告，表示不惜动用武力也要制止此行为（阻止P.L.A.N.T.生产自己的食物）。理事国与P.L.A.N.T.爆发小规模冲突，扎夫特（ZAFT）部署了YMF-01B 原型基恩（PROTO GINN）进行防卫，最后以少胜多压制了地球联合军的MA部队并将其驱逐出P.L.A.N.T.周边宇域。正是在这一点上，原型基恩的存在和扎夫特作为军事组织的性质被公诸于世。 大西洋联邦宇宙军第4舰队（后来的地球联合第8舰队）的哈尔巴顿上校发现了MS在宇宙战斗中的优势，遂向司令部提交了代号为“G系列”的开发提案。大西洋联邦因而开始研发机动战士。该提案却被大西洋联邦的高层拒绝，但在一些大西洋联邦参议员的支持下继续秘密进行。 在同年9月1日基拉·大和就读于海利欧波里斯的工业学院。 在同年11月3日，由P.L.A.N.T.的国营军事设计局的阿西莫夫设计局、海因莱因设计局、麦乌斯军事工社在YMF-01B 原型基恩（PROTO GINN）的基础上进行修改并共同开发出扎夫特的第一款泛用量产型机动战士ZGMF-1017 基恩（GINN）而对其机体进行量产。在基恩大规模量产后，原型基恩从前线退役并用于新人驾驶员的训练，其原有番号则变更为ZGMT-01，更名为「训练型基恩」。 西盖尔·克莱因议长要求理事国让P.L.A.N.T.能够完全自治和能进行平等的商业贸易。P.L.A.N.T.最高评议会多次试图与理事国谈判，但没有收到任何回应。使P.L.A.N.T.最高评议会宣布：如果在CE 70年1月1日之前没有收到回复，他们将停止向地球出口资源。理事国和P.L.A.N.T.之间的紧张关系开始升级。 一名P.L.A.N.T.最高评议会成员在后来被称为“未举行的会议”中与来自理事国的代表会面。但在一场恐怖袭击下夺去了一名理事国成员的生命。蓝色宇宙（Blue Cosmos）则声称对这次袭击负责，但当理事国显然是幕后黑手时，P.L.A.N.T.停止了所有资源的出口。使这些依赖P.L.A.N.T.出口的理事国变得一贫如洗。而在理事国之一的大西洋联邦的宣传下导致地球上反P.L.A.N.T.和反协调员的情绪高涨。 联合国主持在月面都市哥白尼举行的P.L.A.N.T.与理事国之间的会谈，但会谈的会场却遭遇到炸弹恐怖袭击（哥白尼惨剧），地球方面理事国代表与联合国秘书长以下的联合国首脑群死亡。然而，P.L.A.N.T.方面的代表西盖尔·克莱因议长因为太空船故障而迟到，因此逃过一劫。 理事国之一的大西洋联邦发表《阿拉斯加宣言》，宣称此次恐怖袭击是P.L.A.N.T.所为，并指袭击是对地球和自然人的宣战。大西洋联邦并宣布成立地球联合，取代因首脑全数死亡而瘫痪的联合国。 欧普代表乌兹米·纳拉·阿斯哈宣布：「以后不论事态如何，欧普始终贯彻独立性、中立性的原则。」（《阿斯哈代表的中立宣言》） 地球联合军对P.L.A.N.T.宣战。从月面的托勒密基地开始侵略攻击。此外，一名隶属于蓝色宇宙的军官下令将一枚核弹秘密地运进MA空母“罗斯福”号内。 P.L.A.N.T.出动了MS部队将敌军歼灭。但由于受到核弹攻击，120座P.L.A.N.T.宇宙殖民地中的一座，农业卫星“尤尼乌斯7号”遭到毁灭性的破坏，同时造成24万3721人死亡，当中包括帕特里克·萨拉的妻子蕾诺亚·萨拉。地球方面则批评此事件是P.L.A.N.T.方面的自爆作战。史称血色情人节。 由于尤尼乌斯7号受到袭击，血色情人节战争正式爆发。 西盖尔·克莱恩议长，在悼念“血色情人节”牺牲者的国葬之际，发表《独立宣言》以及《对地球联合的彻底抗战》。（《黑衣（丧服）独立宣言》）。并且，对未参加联合军的国家优先提供物资（《克莱因议长的积极中立劝告》）。非P.L.A.N.T.理事国的大洋洲联合、南美合众国接受此劝告。 地球联合以武力侵略亲P.L.A.N.T.的南美合众国，并对巴拿马宇宙港进行了军事压制，南美大陆被并入大西洋联邦。 大洋洲联合批评联合军侵攻中南美，并表明对P.L.A.N.T.的支持。亦即成为“亲P.L.A.N.T.国家”，联合军以其属盟国而对其宣战。 联合军通往月球的桥头堡，即L1发生世界树攻防战，地球联合军投入第1～3舰队。拉乌·鲁·克鲁泽驾驶基恩出击，共击坠MA37架、击沉战舰6艘，因功被授予星云勋章。最终，世界树崩坏，成为碎石带的尘土。札多也将带有能抑制核分裂能力的“中子干扰器”试验性地投入实战，虽然成功地证实了它的有效性，但在双方的战斗中札多也不可避免地遭到极大的损害。 扎夫特军开始对地球进攻，在初次从轨道降落到地球的降下作战中，侵略维多利亚宇宙港。然而，因为并未获得地球上的战力支持，因此失败。（第一次维多利亚攻防战） 札夫特发动Operation Ouroboros，从地球的卫星轨道上降落散布「中子干扰器」(在中子干扰器底部，安装了一枚可以钻入地表数百米的钻头，在发动后会将整台干扰器埋进地中。虽然此举可以避免被地球连合军轻易破坏，却同时为回收修理增加困难。干扰器倚靠地热转换为电力，除了偶然机会受到地壳变动而压坏外，一般而言都以半自动运作，有效范围极广，即使只在地球放置数枚、又埋进地底中，其影响已足够覆盖全球）。使地球联合的诸多国家因中子干扰装置的影响而遭受严重的能源危机，国家陷入物资匮乏状态，甚至有人饿死。民众反P.L.A.N.T.、反调整者的情绪达到顶点。史称愚人节危机。 札多趁著混乱，发动卡奔塔利亚湾压制战。从轨道上把基地设施分批降落到亲P.L.A.N.T.国家大洋洲联合澳大利亚地区的港湾——卡奔塔利亚，并在48小时内完成了卡奔塔利亚基地的基础建设。联合军太平洋舰队前往迎击，大败收场。 联合军第5、第6舰队以P.L.A.N.T.本国为目标从托勒密发动进攻，并在P.L.A.N.T.管理下的资源卫星雅金·杜埃附近与札多交战。P.L.A.N.T.评议会从防卫本国的角度出发，决议将雅金·杜埃改装为防卫要塞。（第一次雅金·杜威攻防战）。 札多以托勒密为目标开始进攻联合军月面基地，并在月球内侧的洛伦兹环形山设立了基地。双方以格利马尔迪环形山为界，将月球分为两部分，不断发生小规模的冲突（以后月面战线就被称为「格利马尔迪战线」）。 卡奔塔利亚基地完成。将作为地面战力而事先开发出的空战用MS AMF-101 迪因（DINN）予以配备。 札多以卡奔塔利亚为桥头堡，正式开始对地球上的据点进行攻击。开始进攻地中海地区。 在卡萨布兰卡海域，地球联合军（大西洋联邦主力）的地中海舰队与扎夫特军潜水空母舰队发生冲突，扎夫特军于此次战争中初次使用水中用MS，大胜。之后开始由非洲北岸向南侵略、开始建设直布罗陀基地。 扎夫特军进攻联合军在北非所属的阿莱曼，通称阿莱曼攻防战，别名阿莱曼会战。扎夫特军于此战投入TMF/A-802 巴库（BuCUE），大胜。（苏伊士攻防战）从此，札多由非洲北岸开始南下（“非洲战线”）。此役之后，安德鲁·包扑菲杜便被誉为“沙漠之虎”。 在格利马尔迪战线的联合重要资源供给基地恩底弥翁环形山展开攻防战（格利马尔迪战线攻防战）。在这场战斗中，穆·拉·福拉加驾驶MA莫比乌斯击坠了5架基恩，被誉为“安德米翁之鹰”。拉乌·鲁·克鲁泽作为罗拉西亚级战舰“伽伐尼号”的舰长参加战斗。因击破第3舰队的功绩而得到提升的拉乌·鲁·克鲁泽得到新造的纳斯卡级战舰威萨利乌斯号，而克鲁泽队成为札多军队负责特殊任务的精英部队。虽然遭受了第3舰队全灭的惨痛打击，但联合军刻意使用于破坏矿床、设施、及融化蕴含稀有金属的冰块的设备—“独眼巨人”失控，击破札多军。由于这次败退，札多放弃了格利马尔迪战线，暂时从月球撤退。 东亚共和国所属的资源卫星「新星」遭扎夫特军侵略，爆发新星攻防战，双方均未取得决胜负的一击，在将近一个月内不断发生小规模的交锋。期间，L4的宇宙殖民地群大多受损。 联合军放弃此卫星，扎夫特军将此卫星改造为军用宇宙要塞波亚兹并移送到L5。后来地球联合军数次企图夺回，未成。 自此时起，双方间大规模军事行动减少，不论是地球上或是宇宙中，不断发生小规模冲突，全面陷入胶著状态。为打开战局，由第8舰队司令哈尔巴顿准将所提出的开发联合制MS的计划（即G计划）重获采用，欧普的企业摩根雷堤社也涉入其中，连同作为运用舰的MS搭载型战舰大天使号开始在海利欧波里斯进行正式开发。 阿斯兰·萨拉于士官学校毕业，和伊撒古·尊路、迪安卡·艾斯曼、尼哥路·亚玛路芙菲等人一起被配属于克鲁泽队。 为了打破胶著的状况及改善饥饿的状态，及以结束战争为最终目标，在马尔奇奥导师的斡旋下，地球联合秘书长奥尔巴尼与克莱因议长一度计划进行秘密会谈。但是交涉最终还是破裂了。 太平洋北回归线战线的战斗激化，札多攻击东亚共和国的高雄宇宙港。 在海利欧波里斯，GAT-X系列及新型战舰秘密出厂。 高雄宇宙港陷落。 在获知联合军正在L3建造新型极秘密军事卫星的情报后，克鲁泽队立即出击。然而该情报是错误的，也并未发生战斗。但在归航途中，克鲁泽队从潜入海利欧波里斯的间谍那里得到了有关联合军MS的情报。 为了夺取地球联合军委托欧普联合首长国所开发的实验型MS而进入海利欧波里斯并成功夺取其中4台，只有一台MS没有被夺，并让调整者基拉·大和（民间人）作为驾驶。两方交战6小时后，海利欧波里斯崩坏，成为碎石带的尘土。 由于大天使号是在出发前受到袭击，因此处于物资不充足之急需补给状态。在经过商讨之后，终于决定前往联合军中一员欧亚联邦之军事卫星，拥有号称「阿尔缇蜜斯之伞」之「阿尔缇蜜斯」。但大天使号之行动被克鲁泽队所预知，并在「阿尔缇蜜斯」前布下陷阱等待；在一番苦战之下，成功使敌人受损后退的大天使号终于能够进入「阿尔缇蜜斯」，但由于欧亚联邦之窃视，大天使号不单未能得到补给，船上之成员还被看守起来，几乎所有资料都受到复制，在不知可惜还是可喜的情况下，札夫特利用GAT-X207 电击钢弹攻入了「阿尔缇蜜斯」中，大天使号乘此机会出逃，「阿尔缇蜜斯」受创。 在“血色情人节”一周年纪念仪式前夕，与前往尤尼乌斯7号残骸的追悼慰灵团同行的拉克丝·克莱因的乘船银风遭到攻击，后来在2月3日拉克丝·克莱因被在碎石带中寻找可用资源的大天使号给搭救)。 大天使号试图与第8舰队先遣队合流，但先遣队被克鲁泽队歼灭。与先遣队同行的大西洋联邦阿斯达事务次官死亡。 之后基拉·大和私自将拉克丝·克莱因交回札夫特。 大天使号在与第8舰队会合前受到克鲁泽队的决斗钢弹等人袭击，在这次战斗煌初次发动SEED击退决斗钢弹，大天使号与哈尔巴顿准将的第8舰队正式会合 与第8舰队合流的大天使号试图降落到地球上，但遭到克鲁泽队的追击。为了掩护大天使号，第8舰队被歼灭。在议会重新商讨“沃洛波罗斯作战”的压力下，札多强化了非洲战线的军力。同时维多利亚宇宙港在「第二次维多利亚攻防战」被札夫特给攻占。 在P.L.A.N.T.举行了“血腥情人节”追悼仪式，这时传来维多利亚陷落的捷报。 同日大天使号降落到位于札多势力范围内的非洲共同体内的利比亚沙漠（原本的目的地为地球军基地阿拉斯加，却为了保护攻击钢弹而偏离轨道）。 巴尔特菲尔德队追击大天使号失败，巴尔特菲尔德队被歼灭。 大天使号到达麻六甲海峡，与等在那里的札多部队交战。萨拉小队由于潜水空母发生故障，并未参与战斗。大天使号虽未受到致命的损害，但多处中弹受损。 大天使号抵达欧普近海，并遭到萨拉小队的追击。由于在麻六甲的中弹受损而陷入苦战的大天使号伪装坠落以进入欧普领海，在欧普的淤能碁吕岛入港。 欧普提出以作业系统开发及攻击钢弹的战斗资料以作为大天使号及攻击钢弹的补给交换条件，而大天使号方面亦答应此条件。因此，煌·大和在淤能碁吕岛的地下基地协助开发“MBF-M1 M1异端式”（M1 Astray）。并为M1异端式开发一套完整的作业系统给自然人驾驶者。 P.L.A.N.T.评议会举行议长选举，派屈克·萨拉就任议长，并表明了强硬路线，在议会提出了“沃洛波罗斯作战”的强化案“Spit Break作战”，同日获得表决通过。但是，此时所提出的作战目标为巴拿马。 大天使号自欧普出航，其后遭到萨拉小队的追击。尼哥路·亚玛路芙战死。 萨拉小队在马绍尔群岛攻击大天使号，全力来袭的萨拉小队和大天使号两败俱伤。托路·基利比战死，基拉·大和行踪不明；另外，迪安卡·艾斯曼成为俘虏。在经过简单修理后，虽然可再次航行，但札夫特也有援军到来，大天使号只能放弃搜索攻击钢弹，并向欧普发出求援信号后继续向阿拉斯加进发。 基拉·大和被马尔奇奥导师秘密带到P.L.A.N.T.阿普利留斯市的克莱因邸。 马尔奇奥导师向P.L.A.N.T.评议会提出《奥尔巴尼让步案》，但遭到否决。 大天使号到达阿拉斯加的约书亚。阿斯兰自克鲁泽队转属，从卡奔塔利亚基地出发回国。 玛琉·拉米亚斯出席查问会。 同日Spit Break作战发动：但因攻击目标的变更，所以从发令到实际攻击开始，时间长达72小时。期间，拉克丝·克莱因将自由高达托付给基拉·大和（自由高达强夺事件）。 穆·拉·福拉卡、兰达露·巴芝露与佩莉·亚斯达因转属命令而离开大天使号。Spit Break作战第一波攻击部队抵达阿拉斯加，作战开始。佩莉·亚斯达被拉乌·鲁·克鲁泽俘虏。基拉·大和驾驶自由高达介入阿拉斯加的战斗。联合军启动了“独眼巨人”系统，阿拉斯加基地被毁。此时，联合军首脑群极秘密地乘坐潜水艇脱逃。对于约书亚的被毁，对民间的报导内容是「札多使用新型的大型破坏武器」。欧亚联邦、东亚共和国对阿拉斯加作战表示了不满，与大西洋联邦之间渐生嫌隙。 克鲁泽队重组，阿斯兰和伊扎克的同期同学兼旧友志保·哈尼夫斯作为红衣精英加入克鲁泽队。 大天使号脱离联合，泊于欧普进行修理。 阿斯兰·萨拉受领正义高达，降落到地球上。 札多攻击巴拿马基地，并使用超级武器Gungnir系统。巴拿马宇宙港被破坏。另外，联合军在这场战斗中首次将量产型MS GAT-01 攻击刃（Strike Dagger）投入实战。为了这场战斗，札多特地缩小了非洲战线，自直布罗陀基地导入大量兵力。 大西洋联邦第4海上舰队南下，要求欧普阿斯哈代表辞职、议会立刻解散并放弃武力，并给予欧普48小时的考虑时间。 卡瑟·巴斯卡克等11人离开大天使号。阿斯兰·萨拉在马绍尔群岛的小岛上与马尔奇奥导师会面。由于阿斯哈代表拒绝了大西洋联邦的要求，大西洋联邦遂发动了“欧普解放战”。联合军新型GAT－X系列机体瘟神高达、禁断高达和猎杀高达初次投入实战；而欧普秘密开发的MS“M1迷惘高达”同样初次投入了实战。阿斯兰·萨拉驾驶正义高达介入了战斗。基拉与阿斯兰再次相逢。 阿斯哈代表怀著战败的觉悟，让大天使号与草薙号向宇宙脱离，并与曙光社、辉夜以及淤能碁吕岛的地下军事设施共同自爆。由欧普下议院所选举出来的临时政府接受了大西洋联邦的劝降通告，欧普成为大西洋联邦的保护国。 草薙号在轨道上的船体各部份进行大气圈外的接合，与大天使号一起向L4开始移动。 以欧亚联邦为主力的联合军发动“第三次维多利亚攻防战”，进攻札多占领下的维多利亚基地。由于突击达加的大量投入及阿拉斯加战役之后札多地上军的弱化，战局向有利于联合的方向发展。数种突击达加的衍生机体和新型试作机等也投入了战斗，进行实战评价。 兰达露·巴芝露就任大天使级二号舰“主天使号”的舰长。 维多利亚宇宙港陷落，自爆装置也在启动前一刻被突入的特殊部队阻止。 在被联合军夺回后，维多利亚就成为联合的主力宇宙港。 伴随著维多利亚的陷落，P.L.A.N.T.评议会宣布加强宇宙战力。 大天使号到达L4的卫星“孟德尔”。 阿斯兰·萨拉回到P.L.A.N.T.与父亲见面。拉克丝·克莱因与安德鲁·包扑菲杜一起夺取了新造战舰“FFMH-Y1001 永恒号”（Eternal）。其后7月5日，“永恒号”到达孟德尔，与大天使号及草薙号合流。 克鲁泽队接受了追击“永恒号”的任务，到达L4。 主天使号在孟德尔与大天使号展开战斗。基拉·大和、穆·拉·福拉卡与拉乌·鲁·克鲁泽在孟德尔内部碰面，基拉·大和得知了自己出生的秘密。佩莉·亚斯达带著“中子干扰调解器”的设计图到达主天使号。克鲁泽队纳斯卡级战舰“威萨利乌斯号”被击沉，舰长亚迪斯战死。其后，以拉克丝·克莱因为中心的“永恒号”及以下船舰，在与欧普残党、P.L.A.N.T.的旧克莱因派、联合的和平派等取得联络的同时，还为和平及早日结束战争而奋斗。在马尔奇奥导师的努力下，“永恒号”一行获得回收业组织等的支援，得以转战各地。 联合首脑会议秘密通过决议，决定开始开发搭载“中子干扰调解器”的核弹，并编成“维和队”。被俘虏的佩莉·亚斯达因顺利逃脱且带回“重大而有益”的情报而得到晋升，被配属于主天使号。 地球联合军发动“第二次卡萨布兰卡海战”，进攻直布罗陀基地，札多放弃直布罗陀，开始从欧洲撤退。 地球联合军发动以攻击卡奔塔利亚基地为最终目标的“八八作战”。地球联合军对大洋洲联合的攻击日趋激烈。地球联合军将自维多利亚基地送上轨道的MS部队降下，与来自澳洲内陆的地上部队及太平洋舰队以澳洲东、北岸为目标进行夹击。自此时起，MS、人员、物资从维多利亚宇宙港陆续抵达月球。开始流传将要发生大作战的流言。 地球联合军司令部以攻击P.L.A.N.T.本国为最终目标的“艾尔维斯作战”发动，极秘密地从各方面集结战力。 地球联合军发动“博亚兹攻略战”，由于维和队所进行的核攻击，博亚兹陷落。 地球联合军发动“第二次雅金·杜埃攻防战”，对P.L.A.N.T.本国进行的核攻击被前来介入的拉克丝等人所阻止。札多使用“创世纪”，第1次发射击毁了联合军40%以上的战力。 “创世纪”第2次发射，将兼负补给任务的第2波攻击部队全灭，并摧毁月面的托勒密基地。主天使号被击沉。穆·拉·福拉卡、兰达露·巴芝露、“蓝色宇宙”的总帅穆达·阿兹莱尔、佩莉·亚斯达与拉乌·鲁·克鲁泽战死（其后的《SEED DESTINY》中，穆·拉·福拉卡经过洗脑后以尼欧·罗安那克再次登场）。派屈克·萨拉被部下击毙。雅金·杜威自爆，而“创世纪”也由于进入其内部的正义高达的自爆而被破坏。 同日被抵抗组织救出的爱琳·卡纳巴等旧克莱因派议员向地球联合军提出停战要求。雅金·杜威攻防战的第二次战役后，地球联合军和扎夫特军停火。 南美洲独立战争。 地球联合军与P.L.A.N.T.临时评议会在“尤尼乌斯7号”的遗迹上空缔结了停战条约（尤尼乌斯条约），标志着血染情人节战争的结束。条约规定禁止MS使用核引擎及反中子干扰器，禁止海市蜃楼技术用于军事途径，还对MS的保有数进行了限制。而被大西洋联邦吞并的南美合众国恢复独立，恢复欧普的独立主权；札夫特（ZAFT）将高雄基地返还给东亚共和国以及撤出卡奔塔利亚基地和直布罗陀基地以外的地上据点。 伊扎克、迪安卡、志保归队。焦耳队成立，队长是伊扎克·焦耳，副官是迪安卡·艾斯曼，志保·哈尼夫斯是精英小队的队长，配属战舰是伏尔泰号和卢梭号。 成为欧普的代表首长的卡佳里·尤拉·阿斯哈在化名为亚历士·帝诺的阿斯兰·萨拉陪同下来到P.L.A.N.T.位于L4的宇宙殖民地“Armory One”（军火库一号），与P.L.A.N.T.最高评议会议长吉伯特·杜兰朵进行秘密会谈。会谈期间，军火库一号札多新G系列被强夺事件发生（第一军械库奇袭），真·飞鸟驾驶“脉冲钢弹”第一次出击，大地钢弹、深渊高达（Abyss）、混沌钢弹（Chaos）三台新型机被所属不明的部队（Bogey One）夺走。军火库一号及其港口受损，卡佳里受轻伤。札多新型宇宙战舰LHM-BB01 智慧女神号（Minerva），载著戴兰达议长以及卡佳里、阿斯兰开始追踪Bogey One。 P.L.A.N.T.方面，侦测到了尤尼乌斯七号往地球方向移动的消息，杜兰朵议长下达了智慧女神号前往执行破坏任务；地球方面，得知了尤尼乌斯七号即将落下的消息而发布了紧急避难命令，理法（Logos）领导人吉普列则在一处冷眼看待。 扎夫特军在尤尼乌斯七号执行破坏任务。不清楚状况而插手的不明舰一部队、神秘的基恩部队、焦耳队与智慧女神号部队爆发了大混战。途中，焦耳小队成功的分裂了大半部分残骸，但仍有一半往地球坠落。不明舰及焦耳队因接近空降临界点而返航，智慧女神号决定要空降地球，并且途中以阳离子破坏砲继续摧毁残骸，但终究无法完全破坏残骸。阿斯兰与真无法归舰，只能直接降落地球。 在地球，拉克丝·克莱因带领著一群小孩避难，煌·大和在海岸边看著巨大火球落入大气层。 尤尼乌斯7号坠落地球事件发生，世界各地如巴黎、上海及希腊等遭到了坠落的尤尼乌斯七号的严重破坏，流离失所与死伤的人数无法估计。先行返回P.L.A.N.T.的杜兰朵议长则发表了紧急谈话，并且给予地球莫大的援助。但在「蓝色宇宙」的情报操作下，基恩在尤尼乌斯七号上的活动被公开，带给地球一片骚动。 真与阿斯兰突破大气层后，与智慧女神号会合。在卡佳里的建议下，智慧女神号开往了欧普。 欧普政府中，以赛兰家为首的亲地球派占了上风，使卡佳里形同傀儡。阿斯兰与煌交谈。 阿斯兰决定前往P.L.A.N.T.尽一份心力。 面对地球联合军的进逼，P.L.A.N.T.也下达了红色警戒，第二次血腥情人节战争再次爆发。就在此时，联合军居然以核弹向殖民地进行突袭，P.L.A.N.T.早有预防，以新型磁共振设备化解了危机。 杜兰朵议长以「行使自卫权」为由，进行大量增援地球札夫特军队的方案。 紧急离港的智慧女神号，被埋伏的地球联合军偷袭。 乌那特逼迫卡佳里与其子尤纳·罗马·圣兰进行政治联姻，以利圣兰家全面掌握欧普政权。 一群调整者的特种部队潜入暗杀，目标是拉克丝。众人逃进防空洞之后又被MS--UMF/SSO-3 亚修攻击。在安德鲁的劝告下，拉克丝打开了舱门，煌再次驾驶自由钢弹。扫平了特种部队的MS，特种部队的MS部队以自爆了结。 煌与玛琉开启沉睡在欧普海底的大天使号，并将卡佳里绑走。在欧普军官特达轧上校的回让下，大天使号开出了领海。 智慧女神号受命自卡奔塔利亚基地出发，向西北前往直布罗陀。离开卡奔塔利亚基地没多久，于印度洋上的苏门答腊近海遭遇遭遇「幻痛」的尼欧率领的联合军MS攻击，印度洋攻防战展开，真·飞鸟在与盖亚钢弹交战中意外发现了正在建设中的印度洋前线基地，同时目击大量当地居民被联合军以暴力强征为建设基地的苦力，试图逃走的劳工惨遭射杀。最终驻守MS部队的全灭迫使「幻痛」撤退，真·飞鸟破坏了基地并解放了当地民众。随后智慧女神号前往札夫特攻略苏伊士运河的前线，位于波斯湾的玛哈姆尔基地。 智慧女神号到了苏伊士附近的札夫特基地玛哈姆尔基地并得知，为了孤立联合军的苏伊士基地，亟需拔除地球军的战略据点是位于中东地区的喀尔纳罕基地。该基地不但建设于易守难攻的山岳内部，唯一通道的溪谷尽头还设置有巨大阳电子砲「罗安格林」以及装备了阳电子反射器的新型巨大MA杰尔兹克防守著，被称为「罗安格林关卡」。喀尔纳罕基地攻防战展开，最后札夫特军在喀尔纳罕摧毁了联合军的新型MA及罗安格林砲，获得了空前的胜利。随后智慧女神号前往黑海沿岸都市迪欧基亚的札夫特基地。 智慧女神号通过马尔马拉海，进入达达雷海峡后即与联合军同欧普军组成的联合舰队展开激战，达达雷海峡之战爆发。就在智慧女神号正要向欧普军的护卫舰群发射阳电子砲的寸刻之前，自由钢弹突然介入破坏其砲身，接著对三方展开无差别攻击，并间接造成智慧女神号的新队员海涅·威斯坦弗斯驾驶的古夫烈焰型惨遭盖亚钢弹腰斩。脉冲钢弹亦在自由钢弹的强袭下失去右手。 退回马尔马拉海港口进行维修、补给作业的智慧女神号，突然侦测到盖亚钢弹单机前往联合军培养强化人的中心「卢西尼亚实验室」。 脉冲钢弹和救星钢弹随即出动，一番交手后本机成功压制了盖亚钢弹并俘虏其驾驶员史黛菈·路歇。 克里特外海战：智慧女神号于克里特岛附近海域再度遭到联合与欧普同盟军围攻，中途自由钢弹和大天使号再次介入。数量上处于绝对劣势的智慧女神号面对机海战术以及欧普军的自杀式特攻逐渐支持不住，不但船体受损严重，瞬发型萨克幽灵和砲击型萨克战士受到重创，露娜玛丽亚·霍克亦身受重伤。真·飞鸟SEED觉醒，漂亮地闪避了自由钢弹的攻击，随后击破深渊钢弹。真·飞鸟以单机之姿歼灭欧普军舰队，并完全击沉其旗舰建御雷号，拯救了智慧女神号。 为了铲除欧亚联邦西侧的札夫特势力及当地的反联合气燄，理法命令「幻痛」以新型的巨大MS—破灭钢弹为主力，摧毁三个城市后继续侵攻柏林，市民受到波及而伤亡惨重。即便是自由钢弹也无法予之损伤，智慧女神号赶到后派遣脉冲钢弹迎击。本机一出动即展现超级王牌的实力，迅速地突破破灭钢弹的弹幕并切开其驾驶舱门。欲接续下一击时，被尼欧·罗安那克的威达阻挡并告知破灭钢弹上的驾驶员正是史黛菈·路歇，真·飞鸟震惊之中本机停止动作。真·飞鸟为了唤回史黛菈·路歇，以脉冲钢弹本机拦阻了自由钢弹的攻击，接著以放下武装的姿态靠近破灭钢弹。看似将要成功之时，自由钢弹的接近导致史黛菈再度暴走，破灭钢弹突然再度做出准备砲击的态势。自由钢弹趁隙破坏了破灭钢弹即将发射的砲口，引发爆炸造成史黛菈·路歇伤重死亡，史称柏林之战。 以札夫特为首的反理法同盟军集结于直布罗陀基地后，紧接著包围位于冰岛的地球联合军最高司令部——天堂基地，要求交出战犯‧理法盟主兼蓝色宇宙新盟主的洛德·吉布列。然而地球军理法派部队无预警的奇袭，使天堂基地攻防战(Operation Ragnarok)展开，并出动五机破灭钢弹令同盟军前锋舰队损失惨重。真·飞鸟搭乘命运钢弹出击，发挥强大的速度与攻击力击坠数机威达。接著单独击破两机破灭钢弹，并偕传说钢弹与脉冲钢弹携手攻击打倒一机，最终攻破了天堂基地，同盟军胜利。洛德·吉布列从冰岛「天堂基地」成功逃亡至欧普 欧普因隐匿战犯洛德·吉布列而遭到反理法同盟军举兵攻击，欧普侵略战(Operation Fury)爆发，欧普国防军在卡佳里·由拉·阿斯哈驾驶晓归来后的率领下顽强抵抗。亟欲打垮欧普的真·飞鸟驾驶命运钢弹出击，迅速击破数机村雨并完全压制晓，然而最后一击却被突然空降下来的攻击自由钢弹阻挠，本机与之激斗。随著战事陷入胶著，智慧女神号推进前线参战，命雷·札·巴雷尔驾驶传说钢弹出击支援本机。然而命运钢弹疑似因动力机关Hyper Duetrion发生某种错误，无法充电导致残余能量低下，一度撤退归舰。真·飞鸟在机体补给完成后回到战场与传说钢弹一同围攻攻击自由钢弹，正当真将要击坠攻击自由钢弹时，突遭阿斯兰·萨拉驾驶的无限正义钢弹介入。曾被自己杀死的对象却接连现身，真惊愕不已，又被阿斯兰的劝诱所动摇，命运钢弹右手腕遭到无限正义钢弹切断。最终由于洛德·吉布列成功逃往宇宙，失去了大义名分的同盟军撤退。